Les logiciels gratuits de prédiction de lipophilicité : sont-ils fiables ou non?

Plusieurs groupes de recherche universitaire et de compagnies qui ont développé des logiciels de prédiction acceptent de les partager gratuitement pour des fins académiques ou à but non lucratif.  Parmi ces logiciels, ceux permettant d’évaluer la lipophilicité (logP) sont particulièrement recherchés pour leur utilité dans le domaine pharmacologique. Cette étude se penche sur une évaluation de l’efficacité des logiciels gratuits de prédictions de logP. Méthode : toutes les valeurs de logP expérimentales furent extraites de la Enhanced NCI Database 2.2 (N=3577). Ces valeurs furent comparées à celles qui prédisaient les méthodes théoriques : AlogP, KOWlogP, ACDlogP, ClogP, MlogP et XlogP. Selon les résultats obtenus, il semble que pour des molécules plus hydrophiles (logP entre -3 et 0) les prédictions ne soient pas très fiables. Toutefois, la qualité des prédictions s’améliore significativement pour les molécules ayant des valeurs de logP positives. Ensuite, il a été observé que la flexibilité des molécules affecte grandement la qualité des prédictions de logP. Finalement, la qualité des prédictions varie beaucoup en fonction des classes de fonctions organiques (alcanes, alcènes, alcynes, dérivés halogénés et alcools entre autres). En guise de conclusion préliminaire, l’utilisation de ces logiciels est possible, mais pour obtenir des prédictions fiables, il est nécessaire de se restreindre à certains paramètres.