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Le risque d’infections bactériennes dans les exploitations piscicoles est une réalité à laquelle les pisciculteurs doivent continuellement faire face. Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida est un agent pathogène responsable de la furonculose chez les salmonidés. À la suite d’une éclosion de furonculose, l’infection peut être traitée avec des antibiotiques, mais il est fréquent d’observer une inefficacité du traitement en raison de la résistance aux antibiotiques. Cette bactérie possède une grande variété de plasmides responsables de cette résistance. Parmi ces p…

Le flétan du Groenland (Reinhardtius hippoglossoides) est une des principales espèces de poisson de fond exploitées commercialement dans l'est du Canada. Les résultats des travaux génétiques conduits sur cette espèce dans le cadre d’un projet pluridisciplinaire visant à contribuer à maintenir la durabilité à long terme de cette espèce, vous sont présentés. Après avoir assemblé de novo le génome de référence, nous avons généré des séquences de génomes entiers à partir de 1366 flétans du Groenland échantillonnés dans 32 localités de l'Atlantique…

La bactérie Aeromonas salmonicida est connue depuis longtemps comme l'un des agents pathogènes les plus redoutés en pisciculture. Cependant, plus nous en apprenons sur cette espèce bactérienne, plus nous nous demandons s'il s'agit vraiment d'un agent pathogène exclusivement aquatique. Au cours des dernières années, il est devenu évident que cette espèce bactérienne comprend une myriade de souches avec divers modes de vie et niches écologiques, y compris les psychrophiles strictes qui ont été les premières bactéries connues de l'espèce et les souches mésophiles nouvellement décrite…

Au Canada, 12 millions de tonnes d’aliments sont jetées à chaque année, dont 13% sont générées par les hôtels, les restaurants et les institutions (HRI). Cette quantité pourrait augmenter alors que les Canadiens dépensent une proportion croissante de leur budget alimentaire hors foyer. Ainsi, des stratégies de réduction du gaspillage alimentaire (GA) doivent être implantées dans ce secteur afin de contribuer aux avancées vers un système alimentaire plus durable. Toutefois, il y a un manque important d'informations sur les impacts économiques et environnementaux du GA et des stratégies visa…

L'approvisionnement en électricité du Canada à partir de l'hydroélectricité dépasse 60 % de la production totale en énergie. En revanche, la production d'énergie hydroélectrique consomme de l'eau brute en modifiant l'écosystème qui passe alors d'une couverture végétale à de l’eau libre. La quantité d'évaporation des réservoirs hydroélectriques fait écho au concept d'empreinte d'eau bleue : le volume d’eau nécessaire à la production d’un bien, dans ce cas-ci de l’électricité. Cette étude se concentre sur l'évaluation d'un modèle de lac unidimensionnel (Canadian Small Lake Model, CSLM) afin …

Dans le contexte des futures tendances du réchauffement climatique, prédire comment les organismes répondront est un enjeu majeur. Un des mécanismes pouvant intervenir est la plasticité transgénérationnelle à travers des mécanismes génétiques, mais surtout épigénétiques. L’objectif de ce travail est de vérifier si le régime thermique subi par des géniteurs d’omble de fontaine en période de maturation gamétique; froid ( de 11,5° en Septembre à 3° en Décembre) et chaud ( de 13,5° en Septembre à 5° en Décembre), et celui subi par la progéniture en période de développement embryonnaire et d’al…

Depuis plus d’un siècle, les gestionnaires des pêches doivent composer avec d’importantes fluctuations des populations de poissons exploités. Cette situation est en grande partie due à la grande variabilité du recrutement annuel, c’est-à-dire, la quantité de jeunes qui viennent grossir les rangs d’un stock. De nombreux travaux de recherche ont été menés à travers le monde afin de comprendre les facteurs qui influencent la mortalité des jeunes stades de vie des poissons dans le but ultime de prédire le recrutement annuel. Malgré un volume considérable de travaux, la prédiction du recrutemen…

La folle avoine présente de plus en plus de résistance aux herbicides, particulièrement dans les grandes cultures de blé au Lac-Saint-Jean. La recherche de solutions sans pesticides s’avère nécessaire pour préserver la santé des écosystèmes et la santé humaine. L’objectif principal de cette étude est d’évaluer les effets d’un semis tardif sur la densité de folle avoine, les rendements et la qualité du grain dans les cultures de blé de printemps. Trois essais en agriculture biologique et trois en agriculture conventionnelle ont été effectués en 2021 chez des agriculteurs. Le dispositif expé…

L’utilisation de purées de lentilles rouges en tant qu’ingrédient fonctionnel offre la possibilité d’améliorer le profil nutritionnel des aliments tout en générant de nouvelles textures. Si des études précédentes se sont intéressées à l’effet de la taille, forme et concentration des particules dans des purées de fruits et légumes, aucune donnée n’a pour l’instant été générée sur des purées de légumineuses riches en protéines et en amidon. Dans cette étude, la purée de lentilles rouges a été fractionnée en fragments cellulaires, cellules du cotylédon isolées et amas cellulaires par une méth…

La résistance aux antibiotiques est un problème croissant globalement. Bien que plusieurs avenues aient été sondées pour attaquer celui-ci, l’influence des bioaérosols, des particules d’origine biologique en suspension dans l’air, sur la dispersion des gènes de résistance aux antibiotiques (ARG) n’a pas encore été clarifiée. Ce projet examine cette question dans le contexte aquacole via l’échantillonnage de l’air d’aquacultures, suivi de l’analyse et de la comparaison des ARG présents dans l’air et dans l’eau de cet environnement. Comme la flore aérienne des aquacultures n’a jamais été car…

La pollution des océans par les plastiques est devenue une problématique majeure, environ 13 Mt de déchets viennent contaminer les océans annuellement. La problématique des plastiques, est que lors de leur dégradation, ils vont être divisées en des millions de particules nommées microplastiques ou nanoparticules qui sont susceptibles d’être ingérées par les organismes marins. La taille de ces nano/microplastiques (MPs) varie de l’ordre de 100 nm à 5 000 nm. Les techniques usuelles ne permettent pas de détecter les particules de faibles tailles.  Ce projet, permet d’étudier l’effet chroniqu…

L’utilisation d’outils transcriptomiques a connu un essor impressionnant au cours de la dernière décennie en biologie animale. Le consortium GEN-FISH (Génome Canada) s’est lancé comme défi de développer des puces transcriptomiques multi-espèces (poissons d’eau douce) qui pourront être mises à la disposition de l’industrie piscicole (ex. comparaisons inter-souches de performances de croissance, de résistance aux maladies, d’adaptabilité aux changements d’environnements) ou des gestionnaires de la faune (ex. résistance aux stress environnementaux, étant de santé des populations, comparaison …

Afin de réduire l’utilisation des pesticides chimiques, de nouvelles méthodes phytosanitaires sont requises. Dans ce contexte, le recours aux trichogrammes pour le contrôle de la pyrale du maïs, principal ravageur du maïs sucré, représente une alternative économiquement viable aux insecticides. Toutefois, l’utilisation de ce prédateur naturel est limitée par la pénurie de main-d’œuvre et le temps requis pour l’installation manuelle de trichocartes: cartons contenants les œufs parasités. Pour remédier à ce problème, la distribution des pupes de trichogrammes à grande échelle a été mécanisée…

Le lactosérum est un important résidu, issu de la production de fromage. La fermentation avec des levures est prometteuse pour la valorisation de composés présents dans le lactosérum. Par exemple, lors de la fermentation la L-phénylalanine (Lphe) peut être transformée en 2-phényléthanol (2PE), un composé très apprécié dans l’industrie en raison de ses propriétés organoleptiques et biocides. La fermentation du lactosérum en utilisant les levures Kluyveromyces marxianus et Debaryomyces hansenii en mode de coculture a été étudiée. La source de Lphe a été comparée, …

La mytiliculture a une place prépondérante dans l’économie des régions côtières du Saint-Laurent. Récemment, il y a eu un intérêt croissant au développement d’écloseries de moules afin d’obtenir des moules triploïdes. En effet, il est reconnu que la triploïdie réduit généralement la fertilité, menant à une productivité augmentée. Dans cette étude, nous avons comparé les capacités de reproduction de moules diploïdes et triploïdes. Régulièrement, de mai à septembre 2021, pendant la saison de reproduction, des moules diploïdes et triploïdes ont été échantillonnées sur un site d’élevage. Des m…

L’agriculture de conservation est apparue depuis quelques décennies comme une pratique alternative au travail conventionnel du sol pour limiter la dégradation des sols mais les analyses socio-économiques de sa performance et de son adoption par les agriculteurs se heurtent généralement à un problème d’identification des adoptants de l’agriculture de conservation. L’objectif de cette étude était donc de développer un indice composite pour mesurer le niveau d’adoption de l’agriculture de conservation des producteurs de maïs au Québec. Pour atteindre cet objectif, un modèle d’adoption partiel…

Les erreurs systématiques d’une évaluation statistique dans les simulations des modèles climatiques introduisent des biais dans les simulations d’impact ultérieures. Par conséquent, des méthodes de correction de biais sont utilisées de manière opérationnelle pour post-traiter les projections climatiques régionales. Cependant, de nombreux problèmes ont été identifiés, et certains chercheurs remettent en question le fondement même de l’approche. Plusieurs exemples (Maraun et al. 2017, etc.) montrent la capacité limitée de la correction du biais à corriger et à réduire la variabilité, et démo…

Le système de sécrétion de type trois (SSTT) d’Aeromonas salmonicida est un facteur de virulence important pour le développement de la furonculose chez les salmonidés. Cette maladie entraîne de lourdes pertes économiques dans les piscicultures. Des études antérieures ont démontré que la bactérie pouvait perdre sa virulence lorsqu’elle est cultivée à 25 °C, une température plus élevée que sa température optimale de croissance. En effet, la région du SSTT, situé sur le plasmide pAsa5, est perdue dû à une recombinaison homologue des séquences d’insertion entourant la région du SSTT. …

La dulse est une algue rouge pérenne présente dans les zones intertidales rocheuse de l’Atlantique Nord. Dans l’est du Canada elle fait l’objet d’une cueillette commerciale traditionnelle à la main et est séchée pour le marché de l’alimentation. Comme la demande du marché pour cette espèce augmente et que son prix est relativement élevé, elle fait partie des espèces priorisées par le secteur de l’algoculture. Une des stratégies qui est explorée consiste à utiliser les tétraspores des sporophytes fertiles pour ensemencer des substrats et, après une courte étape de culture en écloserie ceux-…

L’analyse des états de faibles débits (étiages...) est faite en privilégiant une approche statistique probabiliste. Le but de la démarche est de fournir à partir d’une approche fréquentielle des indicateurs statistiques qui permettent de caractériser l’état de faible débit et de proposer des cadres réglementaires de gestion et de prévision d’états extrêmes. Cependant, ces plans de gestion se heurtent souvent à une résistance des populations locales. Cela est dû à une prise en compte insuffisante de la dimension perception des populations de ces états de faibles débits dans la planification…

La mariculture au Québec est orientée autour des bivalves comme la moule et l’huître. Ce type d’élevage offre un caractère durable, car qu'il ne dépend pas de l'alimentation sur moulée, mais de la matière organique présente dans la colonne d’eau. Les bivalves remplissent donc d'importantes fonctions écosystémiques pour les habitats côtiers. En filtrant le phytoplancton et en accumulant de l'azote et du phosphore, ils éliminent les nutriments du milieu ambiant. De plus, l'aquaculture des bivalves offre une structure d'habitat supplémentaire et une stabilisation du rivage en plus des revenus…

Les piles représentent un élément clé dans la transition énergétique mondiale qui a pour but d’arrêter la consommation de combustibles fossiles pour atteindre les objectifs de l’Accord de Paris. Néanmoins, les émissions associées à leur production et gestion après utilisation peuvent être nocives pour l’environnement. Le développement de procédés de recyclage des piles alcalines, par exemple par hydrométallurgie, est une étape clé pour diminuer leur impact environnemental. Les piles alcalines sont constituées par 3 fractions : métal magnétique, résidus non-magnétiques et « black …

Le but de ce travail a été d’explorer comment l’expression de gènes (transcriptomique) peut apporter des informations utiles dans la gestion des espèces d’intérêt aquacole (omble de fontaine Salvelinus fontinalis) et halieutique (le sébaste Atlantique Sébastes mentella). Un des aspects les plus importants dans la gestion des espèces est la compréhension de la croissance et du métabolisme, et les études au niveau moléculaire peuvent fournir des informations à un niveau de régulation très en amont des effets mesurables au niveau phénotypique. L’un des principaux apports de …

Les diatomées sont des microalgues siliceuses et des bio-indicateurs puissants en raison de la quantité́ importante d’informations environnementales qu’elles procurent. Elles sont régulièrement utilisées pour évaluer la qualité et l’état des écosystèmes d’eau douce, mais leur usage demeure restreint dans les milieux marins. Les milieux côtiers sont parmi les plus touchés par les changements planétaires. La baie de Sept-Îles (BSI), située dans le Golfe du Saint-Laurent, est le port minéralier le plus important d’Amérique du Nord, exposant son écosystème à plusieurs pressions anthrop…

Les pressions exercées sur la forêt urbaine par les changements globaux (CG) sont un sujet chaud de la recherche environnementale. Connaissant les bienfaits de cette verdure en ville, il est logique de penser que l’augmentation de la couverture arborée répondrait à bien des objectifs de mitigation des impacts des CG. Or, sachant que des facteurs sociaux, politiques et économiques sont à la base de l’aménagement urbain, le point de vue du résident sur ces enjeux est pourtant très peu documenté. Pour combler cette lacune, nous avons mené une étude sur les préférences des résidents des villes…