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La formation de métastases du cancer du sein implique une transition cellulaire d’un état épithélial statique vers un état mésenchymateux mobile (TEM). Cette transition est un processus caractérisé par des changements d’expression génique modulés par des facteurs de transcription et de remodelage de la chromatine. Une littérature grandissante démontre que les ARNs noncodants (ARNnc) sont des acteurs clés dans la régulation de processus cellulaires. Pour identifier les ARNnc régulant la TEM, nous avons utilisé des cellules épithéliales mammaire traitées au TGFb-1 pour induire une …

La découverte de médicaments est un processus long et couteux. Afin d'en accroitre l'efficacité, de nombreuses méthodes informatiques ont été decrites. Dans ce contexte, notre groupe de recherche a développé de nombreux logiciels rassemblés dans la plateforme Forecaster. Cependant ces méthodes sont essentiellement développées pour les médicaments ciblant des protéines. Au cours de cette présentation, nous décrirons nos efforts pour développer des méthodes pour la découverte de molécules ciblant les ARNs.

Les acides nucléiques sont des acteurs attractifs dans le développement de biosenseurs par leur faible coût de production, stabilité et sensibilité. Ces biosenseurs peuvent être créés à partir d’acides nucléiques catalytiques : des ribozymes (basés sur l’ARN), ou des DNAzymes (basés sur l’ADN). Notre groupe a contribué à développer en collaboration plusieurs outils qui génèrent une liste de ribozymes capables de cibler une séquence fournie par l’utilisateur : Ribosoft et TriCleaver. TriCleaver permet de créer plusieurs ribozymes capables de cibler des r…

Canid herpesvirus 1(CHV-1) provoque une maladie hémorragique mortelle chez les chiots et des avortements spontanés chez les chiennes  gestantes. Notre hypothèse est que l'infection par le CHV-1 modifie les niveaux de microARN cellulaires pour promouvoir la réplication virale. Des cellules épithéliales canine sont été soit mock-infectées, soit infectées pendant 6 et 12 h. Les petits ARN totaux ont été isolés, soumis à un séquençage d'ARN profond (RNAseq), et les résultats comparés à la miRbase v22.1. Sur un total de 282 microARN canins, seuls 28 présentaient un changement statistiq…

Face aux progrès de la traduction automatique, quelles possibilités s’ouvrent aux acteurs de la recherche afin de promouvoir un multilinguisme durable dans l'édition savante ? Cette présentation vise à fournir des éléments de réponse et à favoriser un échange constructif pour un usage raisonné de la traduction automatique.

Le défi de l'analyse thématique, conceptuel et argumentatif de  corpus de  textes philosophiques québécois ( académiques et non académiques ) à l'aide d'outils informatiques utilisant des acquis récents de l'intelligence artificielle (IA).

Le 21 juin 2021, les Fonds de recherche du Québec annonçaient leur adhésion à la cOAlition S, un geste fort qui accélère la transition vers le libre accès au Québec, pour un environnement de recherche plus accessible et ouvert. Cette session introductive présentera un retour sur les effets de l’adoption des politiques en faveur du libre accès au Québec.

Le modèle auteur-payeur, dans lequel les auteurs doivent payer des frais de traitement des articles pour être publiés, crée des inégalités et des barrières qui excluent de nombreuses personnes du processus de la recherche, particulièrement dans les disciplines et institutions sous-financées. Nous présenterons des données démontrant l'augmentation des articles publiés en libre accès par les cinq grands éditeurs ainsi que des estimations des frais payés au Canada et dans le monde. Nous examinerons également comment l'introduction de nouveaux modèles commerciaux, tels que les accords de trans…