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Une stratégie couramment utilisée en sciences afin de résoudre un problème complexe consiste à le décomposer en plusieurs parties plus simples, qui peuvent alors être résolues plus facilement. Bien que les molécules d'ARN soient de nature modulaire, l'application de ce type de stratégies pour la détermination de structures tridimensionnelles d'ARN a été plutôt limitée jusqu’à maintenant. Par conséquent, nous avons développé une nouvelle approche combinatoire, que nous avons appliquée afin de déterminer des ensembles structuraux à haute résolution d’un ribozyme VS de Neurospora. En premier …

En 2031, environ 163,000 Canadiens vivront avec la maladie de Parkinson (MP), une maladie neurodégénérative accompagnées de troubles du mouvement. Les traitements existants ne traitent que les symptômes et ont des effets secondaires néfastes. Pour créer de meilleurs outils thérapeutiques, nous devons mieux comprendre les mutations qui causent la MP. Les mutations dans les protéines Parkin et PINK1 provoquent une forme autosomique récessive de la MP. Ces protéines coopèrent pour éliminer les mitochondries endommagées. Lorsque les mitochondries se dépolarisent ou accumulent des protéines mal…

PARP4 est une protéine qui se retrouve au niveau de l’organelle vault et qui effectue des modifications post-traductionnelles. Son rôle cellulaire précis n’est pas déterminé et il existe très peu de connaissances sur sa structure et son mécanisme de régulation. La comparaison des séquences avec d'autres PARP indique que la région catalytique de PARP4 contient un domaine hélicoïdal (HD). Le HD est un domaine autorégulateur présent dans les PARP 1, 2 et 3, qui agit pour bloquer la liaison du substrat NAD+ au site catalytique. La délétion du HD dans les PARP supprime son mécanisme d'auto-inhi…

Les miARN de la famille let-7 sont des acteurs importants dans la cellule car ils régulent la différenciation cellulaire, le développement neurologique et la suppression tumorale. La famille let-7 suit la voie canonique de biogenèse des miARN, dans laquelle le miRNA mature est produit suite au traitement de formes immatures par les ribonucléases Drosha et Dicer. Fait intéressant, dans certains types de cancer, les formes précurseurs des miARN let-7 sont présentes, tandis que les formes matures sont régulées à la baisse, ce qui suggère une mauvaise régulation de la maturation des ARN précur…

Les prostaglandines sont des médiateurs lipidiques impliqués dans la régulation de plusieurs conditions physiologiques tels que l’asthme, la pression artérielle, les maladies cardiovasculaires, les accouchements prématurés et les cancers. Ils agissent sur des récepteurs couplés aux protéines G pour activer des cascades signalétiques intracellulaires qui dictent leurs réponses physiologiques. Le récepteur à la prostaglandine E2 de type 3 (EP3) est ciblé par la prostaglandine E2 (PGE2) et régule les fonctions rénales, la fièvre, les contractions du myomètre, mais aussi les systèmes immunitai…

Les cils cellulaires sont des organites essentiels qui sont des extensions du cytoplasme. Les cils sont constitués d'une structure à base de microtubules appelée axonème. Cette circulaire est faite de 9 doublets de microtubules à la périphérie et d’une paire centrale de microtubules. Dans la plupart des types de cils, l’extrémité distale est distincte du reste du cil. Nous avons utilisé la cryo-tomographie électronique et moyenné des sous-tomogrammes pour obtenir la structure de l'extrémité ciliaire du cilié Tetrahymena thermophila. Nous montrons que les microtubules de la pointe ciliaire …

Les petites molécules peuvent être des outils précieux pour sonder les caractéristiques des protéines et elles peuvent également servir de « leads » pour découvrir de nouveaux médicaments. L'un des moyens les plus prometteurs pour découvrir ces sondes et leads se fait via la stratégie « fragment-based lead discovery » (FBLD). Le FBLD implique l’exploration des bibliothèques de petites molécules (fragments) pour identifier d'abord celles qui se lient faiblement aux protéines cibles impliquées dans les pathologies. Grâce à la chimie médicinale, ces fragments sont ensuite modifiés pour abouti…

Le problème mondial de la résistance des bactéries aux antibiotiques courants stimule la recherche d’approches thérapeutiques impliquant de nouveaux mécanismes d’action. Les molécules qui ciblent la membrane bactérienne, comme les peptides antimicrobiens (AMP) cationiques, constituent une source d’inspiration car ils lysent la membrane lipidique, rendant plus difficile la résistance. Afin de mieux comprendre leur mode d’action au niveau moléculaire, notre laboratoire développe des approches de résonance magnétique de l’état solide (RMN-ÉS) sur des cellules intactes. La RMN-ÉS du deutérium …

PINK1 est une protéine kinase connue comme étant impliquée dans de nombreuses formes de la maladie de Parkinson, une maladie neurodégénérative caractérisée par des symptômes moteurs. Cette protéine est adressée à la membrane externe des mitochondries où elle sera dégradée après avoir lié la Translocase de la Membrane Externe (complexe TOM). En cas de stress mitochondrial, PINK1 ne sera plus dégradée mais accumulée à la surface de l’organelle et cette accumulation entraînera une cascade de recyclage de la mitochondrie, la mitophagie. PINK1 agit donc comme un senseur du stress mitochondrial …

La SUMOylation est une modification post-traductionnelle des protéines qui permet aux plantes de répondre de rapidement à des stress abiotiques comme la déshydratation ou l’exposition à des température extrêmes. La SUMOylation des protéines est typiquement dépendante de la présence de sites de SUMOylation (motif KxE où  est un résidu hydrophobe, K la lysine ciblée par la SUMOylation, x un résidu quelconque et E un glutamate) sur ces protéines. Du fait de leur très petite taille, les sites de SUMOylation peuvent rapidement apparaître ou disparaître au cours de l’évolution sous l’effet de …