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Suite à la démocratisation du séquençage à haut-débit et des plateformes de génotypage, plusieurs avancés ont été réalisées dans le domaine des traits complexes. Il est désormais possible de calculer des scores polygéniques et d’évaluer des fardeaux de mutations à l’échelle génique. Cependant, plusieurs défis de taille sont encore à surmonter. Dans cette présentation, j’aborderai deux grandes questions ainsi que des pistes de solutions. Tout d’abord, il sera question de l’intégration des données omiques dans les associations génétiques des traits complexes. Par la suite, j’aborderai les di…

L’asthme est une maladie chronique qui affecte de 5 à 10% de la population. Elle se caractérise par des épisodes de détresse respiratoire qui peuvent être sévères et même parfois, fatals. Plusieurs altérations structurales du poumon supportent les signes et symptômes de l’asthme, dont l’épaississement du muscle lisse entourant les bronches. Des composés de synthèses ressemblant à certains médiateurs endogènes – les sphingolipides – peuvent interférer avec divers mécanismes qui supportent l’épaississement du muscle lisse. Ainsi, nous nous sommes interrogés sur la capacité des analogues de l…

L’asthme est une maladie inflammatoire affectant plus de trois millions de canadiens et généralement caractérisée par une infiltration d’éosinophiles dans les bronches et une hyperréactivité bronchique. Le traitement de l’asthme consiste généralement en l’utilisation d’un bronchodilatateur et d’un anti-inflammatoire stéroïdien. La prise de fortes doses de stéroïdes peut cependant être délétère et nous devons donc trouver d’autres avenues thérapeutiques abordables afin de traiter l’asthme. Une des stratégies afin d’éliminer, voir abroger l’inflammation de l’asthme, serait de cibler l’enzyme…

L’asthme est une maladie hétérogène habituellement caractérisée par une inflammation chronique des voies aériennes associée à une obstruction bronchique variable. Cependant, on reconnait que l’asthme n’est pas une maladie unique mais un ensemble de conditions qui se présentent selon divers phénotypes ou endotypes. Outre une meilleure définition des phénotypes cliniques basés sur les caractéristiques cliniques ou physiologiques et les facteurs étiologiques, des progrès ont été réalisés dernièrement dans l’endotypage de cette maladie. Ces observations pourront aider non seulement à mieux com…

L’asthme est la maladie respiratoire chronique la plus fréquente au Canada et affecte des patients de tous âges en plus d’être souvent associée à des allergies. Afin d’étudier l’influence de la génétique sur le développement et la persistance de l’asthme, la cohorte familiale d’asthme du SLSJ a été créée il y a plus de 15 ans. Cette cohorte contient plusieurs traits phénotypiques pour 1214 individus. Il est connu que l’asthme peut évoluer au fil du temps. De nombreuses personnes ayant souffert d’asthme pendant l’enfance n’en sont plus affectées à l’âge adulte, tandis que certaines autres d…

La capacité contractile du muscle lisse des voies respiratoires n’est pas fixe, mais plutôt modulée par de nombreux médiateurs inflammatoires. Comprendre cette labilité du muscle lisse est une quête prometteuse afin d’atténuer les symptômes de l’asthme qui surviennent lors d’exacerbations. Cependant, compte tenu de la pléthore de médiateurs potentiellement impliqués et de l’hétérogénéité moléculaire de l’asthme, il est fort probable que plusieurs médiateurs coopèrent afin d’augmenter la capacité contractile du muscle lisse. La tâche d’identifier un remède commun pour un tissu rendu hyperco…

La prévalence des maladies non transmissibles comme l’obésité et les maladies respiratoires comme l’asthme est en hausse partout dans le monde. En accord avec le concept de l’origine développementale des maladies et de la santé, ces maladies pourraient être la conséquence de l’influence (ou interactions) des facteurs environnementaux sur les gènes, et ce, dès la conception, perdurant pendant les stades embryonnaire et fœtal et la petite enfance. Parmi les mécanismes moléculaires potentiellement impliqués, l’épigénétique commence à nous livrer des preuves de son implication dans cette « pro…

Personne aujourd'hui ne peut prétendre connaître la structuration de l'ensemble du champ scientifique par simple immersion dans ce champ, encore moins prétendre pouvoir rendre compte de son évolution depuis les années 1950. C'est ce que les méthodes numériques que j'utilise nous permettent de faire. Je vais présenter le projet en cours sur l'ensemble des sciences sociales et humaines. Le projet terminé sur la science économique a une application web à cette adresse: digitalhistoryofscience.org/economics/ 

Fréquemment utilisés en science des données, les carnets participent activement à la reproductibilité scientifique. Au moment de la création d’un carnet (au format HTML par exemple), le code source est compilé et le résultat de cette compilation, qu’il s’agisse d’analyses statistiques, de figures ou de cartes, est intégré dans le document, le tout étant entrecoupé des écrits de l’auteur. L’objectif de cette contribution est de rendre compte de la création et de l’utilisation de « R Notebooks » en linguistique, et plus spécifiquement en phonétique expérimentale. Les avan…

Comment utiliser l'API Graph de Facebook, ainsi qu'un vieil ordinateur dans mon sous-sol, pour se constituer une base de données de la présence des médias dans le réseau social de Mark Zuckerberg.

La présentation portera sur les origines et le développement de l’application web mise sur pied dans le cadre de mes recherches doctorales, qui appuie maintenant les travaux de plusieurs projets de recherche en histoire et en sociologie de la culture dont La vie littéraire au Québec, le LaboPop, les Réseaux littéraires franco-canadiens et NumaPresse et qui intègre divers modules d’analyse et de visualisation de données : fouille de textes, océrisation, cartographie, analyse structurale des réseaux sociaux, analyse des correspondances multiples, etc. L’application elle-même a été conçue en …

Mon corpus, qui couvre la période 1740-1761, compte quelque 75 000 pages de texte imprimé, où les mentions de l'Amérique sont clairsemées mais présentes dans des contextes très variés: articles de nouvelles, comptes-rendus de spectacles, jeux de vocabulaire, extraits d'ouvrages scientifiques, etc. La fouille de texte était donc absolument nécessaire pour extraire le contenu pertinent de cette masse documentaire. Malheureusement, les textes d'Ancien Régime souffrent d'une orthographe irrégulière et d'une «océrisation» déficiente, causée notamment par le mauvais état des documents qui ont ét…

L’objectif de la communication consiste à présenter un logiciel qui a été conçu en langage Python et qui mesure la précision en mots lexicaux des segments traduits que l’on trouve dans un bitexte. Ce format de fichier bilingue et multilingue est très répandu dans le domaine de la traductologie, de la linguistique de corpus et de la traduction professionnelle puisqu’il est utilisé aussi bien dans les logiciels d’aide à la traduction que l’on appelle les mémoires de traduction qui sont des bases de données qui tendent à remplacer les logiciels de traitement de texte pour la réalisation de pr…

La loi sur l’aménagement durable du territoire forestier prévoit que la gestion des forêts québécoises se réalise selon les principes de l’aménagement intégré. Selon cette approche, pour aménager le territoire forestier de manière durable, il faut prendre en compte les intérêts et les valeurs des différents acteurs du milieu. Bien que les préoccupations et les niveaux de connaissance entre les acteurs varient, il faut planifier l’aménagement sur un territoire commun dans le but de maximiser le bien-être collectif. La Stratégie d’aménagement durable des forêts (SADF) évoque aussi le besoin …

Le nouveau régime forestier promettait de revoir les processus et d’améliorer la gestion intégrée des ressources et du territoire. Ces intentions ont suscité beaucoup d’attentes de la part des autres utilisateurs des ressources du territoire et une certaine appréhension des acteurs de l’industrie forestière. Les coopératives forestières savaient que le défi était grand, mais elles espéraient que les efforts de concertation effectués en amont, pour la gestion intégrée des ressources, faciliteraient par la suite la réalisation des travaux. La Fédération québécoise des coopératives …

Les dernières décennies ont été marquées par des changements majeurs en matière de gestion des forêts publiques au Québec, notamment en vue de mieux intégrer les concepts de la GIRT à l'égard de l'utilisation des terres. D'autres facteurs, comme la certification forestière et les droits autochtones ont également influencés la mise en oeuvre du concept. Dans tous les cas, l'atteinte d'un consensus sur l'utilisation des terres nous apparaît être un élément déterminant de succès. Nous discuterons de quelques-uns de ces changements historiques, de l'approche actuelle et de son efficacité du po…