82e congrès de l'Acfas
Auteur : William Sanger
Colloque : 210 - Technologies de l’information et des communications
De plus en plus d’êtres humains sont connectés entre eux depuis la démocratisation d’Internet et l’avènement des médias sociaux, entraînant l’augmentation du stockage des données personnelles des usagers. Ces données ont pour caractéristiques d’être massives, générées en temps réel, et sont non structurées (messages publiés sur Twitter, recherches effectuées à travers Google, applications mobiles...). L’objectif de notre recherche est de proposer une méthodologie robuste issue de l’industrie financière afin d’extraire l’information pertinente de ces données, l’industrie financière étant un…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Jacob Galan
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
La voie de signalisation Ras/MAPK régule plusieurs fonctions biologiques, incluant la croissance et la prolifération cellulaire. Cette voie est souvent dérégulée dans le cancer, incluant la plupart des cas de mélanome. RSK (p90 ribosomal S6 kinase) est une protéine kinase activée par la voie Ras/MAPK qui est nécessaire à la croissance des mélanomes, mais relativement peu est connu sur sa fonction exacte et la nature de ses substrats.Nous avons utilisé une approche en phosphoprotéomique quantitative pour définir les réseaux de signalisation régulés par RSK. Nous avons défini le conse…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Isabelle Sperano
Colloque : 210 - Technologies de l’information et des communications
L’année 2014 marquera le 15e anniversaire de la maîtrise en design multimédia (MDM) offerte à l’Université Laval. Depuis sa création en 1999, la maîtrise forme des designers spécialistes de l’interface et de l’interaction numérique. Même si plusieurs aspects de la formation permettent à l’étudiant de développer ses aptitudes à la recherche universitaire, il s’agit d’abord d’un programme professionnel, c’est-à-dire qu’il vise surtout à former des designers qui s’intègrent avec compétence sur le marché de l’emploi. S’il est tenu d’acquérir nombre de compétences relatives à son obj…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Daniel St-Cyr
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
Le système ubiquitine-protéasome (UPS) contrôle la dégradation, l'activité et/ou la localisation de plusieurs protéines suite à la conjugaison de la petite protéine ubiquitine par l'intermédiaire d'une cascade d'enzymes nommées E1, E2 et E3 (1200 au total). La famille d'enzymes SCF E3 comprend plusieurs récepteurs appelés F-box qui recrutent des substrats d'ubiquitination en impliquant un complexe composé de l'adaptateur Skp1, la cullin CUL1 et la protéine RING domain nommé Rbx1; cette dernière fournissant le site de liaison pour l'enzyme E2 Cdc34A. Plusieurs protéines F-box jouent un rôl…
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Benoit Potvin
Colloque : 210 - Technologies de l’information et des communications
La logique dynamique est une approche récente située au carrefour de la logique, de l’informatique, de la théorie des jeux et de la philosophie. Celle-ci permet de rendre compte de situations complexes où le comportement d’agents intelligents varie dans le temps en fonction d’échanges d’informations. En effet, les connaissances d’une personne influencent non seulement ses comportements mais aussi ceux des autres agents. On peut alors modéliser ces interactions en prenant compte des préférences, des buts, des mises à jour des connaissances, des stratégies ou encore des capacités de chaque …
82e congrès de l'Acfas
Auteur : William Sanger
Colloque : 210 - Technologies de l’information et des communications
Plus de 500 millions de messages sont publiés quotidiennement sur Twitter. Les entreprises et les consommateurs interagissent et sont connectés entre eux comme l’illustrent autant le marketing viral que les comportements moutonniers. Notre hypothèse est que les conversations sur les réseaux sociaux peuvent ajouter de l’information à l’information financière déjà disponible.La recherche s’appuie sur des bases de données répertoriant l’évolution de la popularité sur Twitter de l’ensemble des compagnies du S&P500. De plus, tous les messages publiés avant l’ouverture des marchés ont été…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Celine Laumont
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
L'immunopeptidome du complexe majeur d'histocompatibilité de classe I (iCMH I) regroupe les peptides présentés par les molécules du CMH I et permet dedistinguer les cellules saines des cellules infectées ou cancéreuses. Les peptides de l'iCMH I sont issus de la dégradation des protéines intracellulaires et plusieurs études protéomiques ont identifié des protéines issues de la traduction de cadres de lecture alternatifs suggèrant que la complexité du protéome pourrait être sous-estimée. Nous avons développé une nouvelle méthode couplant MS et séquençage d'ARN de nouvelle génération afin de …
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Tarik Beldjilali
Colloque : 210 - Technologies de l’information et des communications
Les universités canadiennes forment plus de 1,5 million d’étudiants dont environ 8% proviennent des seize universités du Canada atlantique. Selon l’Association des Universités et Collèges du Canada (AUCC), les retombées économiques de l’activité de ce secteur sont considérables et se chiffrent à 30 milliards de dollars par année pour le Canada. Or, l’Association des Universités de l’Atlantique (AAU) a révélé une diminution des inscriptions étudiantes dans la plupart des universités de l’atlantique Canadien, et ce durant les deux dernières années. Ceci pourrait menacer le fonctionnement de…
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
La maladie de Fabry est une maladie lysosomale liée à l'X qui est caractérisée par l'accumulation de glycosphingolipides tels le globotriaosylcéramide (Gb3) et le globotriaosylphingosine (lyso-Gb3) dans les liquides biologiques et au niveau de certains organes. La thérapie enzymatique de remplacement (TER) est possible selon la gravité des symptômes. Les objectifs de cette étude étaient de découvrir de nouveaux biomarqueurs urinaires et plasmatiques liés au lyso-Gb3 qui reflètent la sévérité et la progression de la maladie. Nous avons utilisé une approche métabolomique afin d'identifier d…
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Nassim Benmesbah
Colloque : 210 - Technologies de l’information et des communications
L’énergie éolienne représente aujourd’hui une source d’énergie verte qui joue un rôle important dans le domaine de l’énergie électrique. Les éoliennes situées dans des zones de climat froid sont affectées par le phénomène de givrage. L’accrétion de glace sur les pales, et l’infiltration du froid dans la structure sont à l’origine de pannes et d’usures prématurées. Un fonctionnement avec une forte accumulation de glace peut endommager l’éolienne et représenter un danger pour la sécurité à cause des jets de glace. Ces effets peuvent diminuer considérablement la production, et être responsab…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Michael Schirm
Colloque : 210 - Contributions de la spectrométrie de masse dans les sciences de la santé et de la vie
Les biomarqueurs représentent des outils indispensables pour le diagnostic et le dépistage des maladies tel le cancer. Le plasma sanguin est une matrice de choix pour l'identification de biomarqueurs car cet echantillon est facilement accessible et contient non seulement des protéines plasmatiques mais aussi des protéines secrétées de tous les organes et des tissus du corps humain. Nous pouvons utiliser le plasma afin de détecter différents biomarqueurs associés à une maladie ou à un état pathologique. Cependant, la découverte de biomarqueurs dans le plasma est très difficile étant donné l…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Stephanie Baud
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Le récepteur de l'élastine (RE) est un complexe trimérique constitué de l'association de 3 protéines : l'EBP (Elastin Binding Protein), la protéine protectrice cathépsine A et la neuraminidase-1. Ce récepteur hétérodimérique est impliqué dans le métabolisme de divers ligands et présente un mécanisme d'action très spécifique et compliqué mettant en jeu une cascade de processus dans le cadre de l'interaction avec les molécules d'élastine, de tropoélastine ou des peptides issus de leurs dégradations. Ce récepteur de l'élastine participe également activement aux phénomènes de signalisation cel…
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Gilles Peslherbe
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Les propriétés de nanoparticules représentatives des domaines du carbone amorphe et graphitique ont été étudiées par calculs de chimie quantique, utilisant la très populaire théorie de la fonctionelle de la densité (density-functional theory – DFT) ainsi que la théorie du champ auto-consistant multi-références (complete-active space self-consistent field - CASSCF). Ils'avère que le caractère semi-métallique des nanoparticules de carbone prédit par la DFT, c'est-à dire la pseudo-dégénerescence énergetique d'états de spin, est de fait confirmé par les calculs CASSCF, une théorie certes plus …
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Dennis Salahub
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Un rapport de progrès vers la modélisation multi-échelles de réactions chimiques dans des milieux complexes sera présenté. Selon le progrès des différents projets, on traitera le processus de transcription, la génération de l'ARN-méssager, par l'enzyme ARN-polymérase, d'une part, et le transfert d'électrons entre protéines, d'autre part. On mettra au foyer la façon de faire fonctionner plusieurs méthodologies dans une approche systémique: chimie quantique (théorie de la fonctionelle de la densité et méthodes semi-empiriques), dynamique moléculaire, méthodes QM/MM, Monte Carlo cinétique, mé…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Xavier Assfeld
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
La très célèbre double hélice de l'ADN est capable de modifier profondément les propriétés photo-physiques de certains chromophores. Les spectres d'absorption ou d'émission UV/Visible peuvent subir des variations en intensité et/ou en longueur d'onde en fonction de la présence de brin d'ADN dans la solution par exemple. La molécule d'ADN est aussi responsable du spectaculaire effet d'interrupteur lumineux que l'on rencontre pour certains complexes de métaux de transition. En présence d'ADN ces complexes peuvent émettre de la lumière alors qu'ils en sont incapables en solution ou vice versa…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Jeremy Schofield
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Un modèle simple de protéine immergée dans un solvant implicite est analysé. Dans le modèle, les monomères interagissent par des potentiels discontinus dont la forme simple permet l'identification de la structure. Il est supposé que les interactions rapides de monomère-solvant fournissent un frottement suffisant pour que le mouvement des monomères obéisse à l'équation de Smoluchowski. Il est démontré par simulation que la vitesse des transitions entre les configurations de la chaîne est bien décrite par la solution de temps moyen de premier passage. En intégrant les vitesses de transition…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Régis Pomès
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
La perméation sélective des ions à travers les membranes des cellules excitables est à l'origine de la génération et de la régulation des signaux électriques dans tous les organismes vivants. Ainsi, les canaux sodiques dépendant du potentiel (NaV) sont responsables de l'initiation et de la propagation du potentiel d'action dans les myocytes cardiaques, les neurones et les cellules endocrines. L'élucidation récente de la structure cristalline du canal sodique bactérien NaVAb ouvre la voie à des études visant à identifier les bases moléculaires de la conduction des ions…
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Armand Soldera
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Outre les applications technologiques des cristaux liquides, cet état particulier de la matière offre un cadre d'étude intéressant pour mieux appréhender le lien entre le microscopique et le macroscopique. Un simple changement structural peut en effet affecter grandement le comportement macroscopique, en particulier le polymorphisme liquide cristallin. Le cas des isomères répondant à cette définition suscite davantage d'intérêt, en particulier du point de vue de la simulation moléculaire. Le même champ de forces est utilisé pour traiter les interactions au sein de ces molécules. De ce fait…
82e congrès de l'Acfas
Auteur : Matthias Ernzerhof
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Les progrès récents concernant la manipulation d'objets à l'échelle atomique rendent possible la mesure de la conductance de molécules attachées à des contacts. Ces dispositifs électroniques moléculaires (DEM) sont des candidats pour la construction d'un nouveau type d'ordinateur. Pour créer un DEM avec une certaine fonctionnalité, il faut d'abord comprendre le mécanisme de transport des électrons dans les molécules. Ce but peut être réalisé en effectuant des simulations. Nous présentons une théorie simplifiée des DEM qui permet son application par des expérimentateurs. En utilisant cette …
82e congrès de l'Acfas
Colloque : 211 - Nouvelles avancées théoriques et numériques en chimie et en biochimie
Les multiplets d'acides aminés sont pertinants à plusieurs phénomènes biophysiques. On connaît que les homomultiplets contribuent au pliement incorrect des protéines et aux désordres génétiques, tandis que les hétéromultiplets jouent un rôle dans la catalyse. Par contre, l'information quantitative sur ces multiplets nous manque; leur fréquence et distribution ne sont pas bien connues en fonction de la longueur et la structure secondaire des protéines. Ici, nous présentons des résults récents sur les propriétés statistiques de la distribution de homo- et hétéromultiplets courts. À partir de…