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Les ribosomes d’une cellule ne sont pas tous identiques. Ils diffèrent, entre autres, par leur composition en protéines ribosomiques. Il semble que cette hétérogénéité pourrait conférer une spécificité aux ribosomes. Nous utilisons la levure Saccharomyces cerevisiae comme modèle pour mieux comprendre l’hétérogénéité fonctionnelle des ribosomes. La plupart des protéines ribosomique de la levure sont encodées par une paire de gènes paralogues. C’est le cas de la protéine ribosomique uS13 issue des gènes RPS18A et RPS18B. Afin d’étudier les différences fonctionnelles entre ces paralogues, nou…

La sous-famille de GTPase Rac régule le remodelage du cytosquelette d'actine et promeut la prolifération cellulaire. Pour cette raison, l'activation de Rac est associée avec le développement du cancer et des métastases. Comme d'autres petites GTPases, l'activation de Rac nécessite des protéines auxiliaires qui agissent comme facteurs d'échange de guanosine (GEF). Parmi celles-ci, on compte notamment Prex et Tiam, de large protéines multi-domaines qui activent Rac via leur domain catalytique DH-PH. La régulation de l'activité de Prex et Tiam et notamment gouvernée par des interactions proté…

Les petites GTPases RAS impliquées dans la signalisation intracellulaire régissent la prolifération et peuvent induire la mort cellulaire. La liaison du GTP leur permet de s’activer, changer de conformation et d’interagir avec différents effecteurs moléculaires, cela détermine alors la voie de signalisation à engager. Les mutations oncogéniques de RAS résultent en leur activation constitutive, ce qui permet aux cellules de devenir cancéreuses. Les analyses biophysiques d’activité de RAS et de leurs interactions avec d’autres protéines conduites jusqu’au maintenant étaient réalisées avec le…

La plateforme de biologie structurale de l'Université de Montréal offre l’accès à plusieurs instruments scientifiques à la fine pointe de la technologie pour répondre aux questions de biologie structurale de la communauté scientifique. Celle-ci comprend trois spectromètres de résonance magnétique (NMR) à haut champs (500 MHz, 600 MHz avec cryo-sonde et 700 MHz) contrôlés par les récentes consoles NEO de Bruker. Un instrument de BioSAXS (diffusion des rayons X aux petits angles) avec robotique pour le criblage à haut débit est aussi disponible. Cet instru…

Les acides ribonucléiques (ARN) constituent une vaste classe, encore largement sous-exploitée, de cibles pharmaceutiques. À-ce-jour, nous estimons que jusqu'à 70 % de notre génome encode des ARNs, ce qui ouvre un champ immense de nouvelles possibilités. Toutefois, en raison du nombre colossal de petites molécules, le développement de méthodes informatiques capable d’identifier efficacement les candidates les plus prometteuses est essentiel. Traditionnellement, cette recherche s’appuie sur la disponibilité de structures tri-dimensionnelles de bonne qualité, mais cette information est relati…

Une stratégie couramment utilisée en sciences afin de résoudre un problème complexe consiste à le décomposer en plusieurs parties plus simples, qui peuvent alors être résolues plus facilement. Bien que les molécules d'ARN soient de nature modulaire, l'application de ce type de stratégies pour la détermination de structures tridimensionnelles d'ARN a été plutôt limitée jusqu’à maintenant. Par conséquent, nous avons développé une nouvelle approche combinatoire, que nous avons appliquée afin de déterminer des ensembles structuraux à haute résolution d’un ribozyme VS de Neurospora. En premier …

En 2031, environ 163,000 Canadiens vivront avec la maladie de Parkinson (MP), une maladie neurodégénérative accompagnées de troubles du mouvement. Les traitements existants ne traitent que les symptômes et ont des effets secondaires néfastes. Pour créer de meilleurs outils thérapeutiques, nous devons mieux comprendre les mutations qui causent la MP. Les mutations dans les protéines Parkin et PINK1 provoquent une forme autosomique récessive de la MP. Ces protéines coopèrent pour éliminer les mitochondries endommagées. Lorsque les mitochondries se dépolarisent ou accumulent des protéines mal…

PARP4 est une protéine qui se retrouve au niveau de l’organelle vault et qui effectue des modifications post-traductionnelles. Son rôle cellulaire précis n’est pas déterminé et il existe très peu de connaissances sur sa structure et son mécanisme de régulation. La comparaison des séquences avec d'autres PARP indique que la région catalytique de PARP4 contient un domaine hélicoïdal (HD). Le HD est un domaine autorégulateur présent dans les PARP 1, 2 et 3, qui agit pour bloquer la liaison du substrat NAD+ au site catalytique. La délétion du HD dans les PARP supprime son mécanisme d'auto-inhi…

Les miARN de la famille let-7 sont des acteurs importants dans la cellule car ils régulent la différenciation cellulaire, le développement neurologique et la suppression tumorale. La famille let-7 suit la voie canonique de biogenèse des miARN, dans laquelle le miRNA mature est produit suite au traitement de formes immatures par les ribonucléases Drosha et Dicer. Fait intéressant, dans certains types de cancer, les formes précurseurs des miARN let-7 sont présentes, tandis que les formes matures sont régulées à la baisse, ce qui suggère une mauvaise régulation de la maturation des ARN précur…