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Le lundi 7 mai 2018

Le séquençage à haut débit (SHD) regroupe des technologies dont les applications de plus en plus diversifiées répondent à de nombreuses problématiques en recherche comme en clinique avec l’avènement des thérapies personnalisées. Ces technologies connaissent encore aujourd’hui des progrès fulgurants afin de les rendre plus accessibles en matière de coût et de manipulation. Elles impliquent cependant un besoin strict en ressources humaines d’expertise adéquate pour produire et traiter les données de SHD. Quoique désormais moins dispendieux qu’à ses débuts, le SHD entraîne tout de même des coûts et requiert des conditions de travail aux standards élevés difficiles à atteindre dans des régions en voie de développement comme en Afrique.

Les maladies infectieuses en zone tropicale posent souvent le problème de délai de réponse en santé publique. Cela dépend en partie de la capacité à identifier les pathogènes responsables lorsque ceux-ci ont émergé ou d’en anticiper l’émergence en amont afin de gérer au mieux les cas qui se présentent. Les émergences virales de ces dernières années en Afrique telles qu’Ebola en Afrique de l’Ouest en 2014 ou encore lZika en Afrique du Sud en 2016 en sont des exemples. Le domaine de la découverte de pathogènes se présente aujourd’hui comme une priorité de recherche pour lequel le SHD constitue un outil précieux. Nombre de pays en voie de développement, où les standards minimum requis font encore défaut, sont concernés.

Ce colloque offrira une série de communications abordant différents aspects des problématiques de santé et de recherche en Afrique auxquels le SHD peut contribuer à répondre. Nous visons ici une réflexion sur les enjeux du SHD, les défis qu’ils imposent et l’intérêt d’investir pour de telles technologies dans des régions où les ressources sont encore limitées.

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Remerciements

Nous remercions très chaleureusement l'ACFAS, l'UQAC et les organisateurs du congrès de nous avoir offert la chance d'animer ce colloque. Nous remercions également nos conférenciers invités ainsi que participants et présentateurs d'avoir répondu présents. Enfin nous remercions nos organismes subventionnaires d'avoir rendu possible cet événement.

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Colloque

Section 100 - Sciences de la santé

Responsables

  • Ingrid Labouba
    Centre International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF)
  • Nicolas Berthet
    Institut Pasteur
  • Andriniaina Andy Nkili Meyong
    Centre International de Recherches Médicales de Francevile (CIRMF)
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Avant-midi

08 h 30 à 10 h 35
Communication orale
Communications orales
Enjeux du séquençage à haut débit en Afrique
Présidence/Animation : Ingrid Labouba (Centre International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF))
Batiment : UQAC
Local : P1-6380
08 h 30
Mot de bienvenue
08 h 35
L’intégration du séquençage à haut débit dans la gestion des épidémies et la surveillance virale
Gary Kobinger (Université Laval)
Résumé
09 h 35
Epidémie nosocomiale de Monkeypox (variole du singe) en République Centraficaine
David Emmanuel Rivalyn Nakouné Yandoko (Institut Pasteur de Bangui), Emmanuel Lampaert (Médecins Sans Frontières - RCA), Séverin Gervais Njdapou (Ministère de la Santé, de l’Hygiène Publique et de la Population - RCA), Isabel Zuniga (Médecins Sans Frontières - RCA), Michel VAn Herp (Médecins Sans Frontières - RCA), Jean-Paul Fongbia (Ministère de la Santé, de l’Hygiène Publique et de la Population - RCA), Thomas Daquin Koyazegbe (Organisation mondiale de la santé - RCA), Benjamin Selekon (Institut Pasteur de Bangui - RCA), Giscard Francis Komoyo (Institut Pasteur de Bangui - RCA), Sandra Miriella Garba-Ouangole (Institut Pasteur de Bangui - RCA), Casimir Manengu (Organisation mondiale de la santé - RCA), Jean-Claude Manuguerra (Institut Pasteur), Mirdad Kazanji (Institut Pasteur de Bangui - RCA), Antoine Gessain (Institut Pasteur), Nicolas Berthet (Institut Pasteur)
Résumé
09 h 55
HPV et cancer du col de l’utérus au Gabon: Profil d’intégration du génome viral dans les lésions cervicales
Andriniaina Andy Nkili Meyong (Centre International de Recherches Médicales de Francevile (CIRMF)), Pamela Moussavou – Boundzanga (Centre international de recherches médicales de Franceville (CIRMF) - GABON), Ingrid Labouba (Centre International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF)), Imaël Hervé Koumakpayi (Institut de cancérologie de Libreville - GABON), Emmanuelle Jeannot (Institut Curie - FRANCE), Stéphane Descorps-Declère (Institut Pasteur), Xavier Sastre – Garau (Institut de cancérologie de Lorraine - FRANCE), Eric Leroy (Institut de recherche et développement - FRANCE), Ernest Belembaogo (Institut de cancérologie de Libreville - GABON), Nicolas Berthet (Institut Pasteur)
Résumé
10 h 15
Infection mixte de peste-des-petits ruminants et de dermatose nodulaire contagieuse chez les chèvres au Sud-Kivu, République Démocratique du Congo
Bwihangane Birindwa (Universite Evangelique en Afrique), Chege George Gitao (Université de Nairobi - KENIA), Patrick Ntagereka Bisimwa (Université 2 Evangélique en Afrique - RDC), Christopher Okafor (Centre de l'Institut international d'agriculture tropicale (IITA) - RDC), Caroline Lilly Bebora (Université de Nairobi)
Résumé
10 h 35
Pause
10 h 50 à 12 h 15
Communication orale
Communications orales
Applications du séquençage à haut débit et impact sur la santé en Afrique
Présidence/Animation : Ingrid Labouba (Centre International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF))
Batiment : UQAC
Local : P1-6380
10 h 50
Techniques de biologie moléculaire: outils de traçabilité de viande de brousse de Cephalophus callipygus Peters - 1876 et Cephalophus dorsalis Gray - 1846
Dr-Ir-Tsef Olivier Miantsia Fokam (Université de Dschang-FASA), Félix Meutchieye ( Université de Dschang - CAMEROUN), Tsi Angwafo Evaristus (Université de Bamenda - CAMEROUN), Robert Skilton (Biosciences eastern and central Africa Hub ILRI - KENIA), Apollinaire Djikeng (Biosciences eastern and central Africa Hub ILRI - KENIA)
Résumé
11 h 10
Caractérisation moléculaire de 7 souches de virus Monkeypox isolés en République centrafricaine entre 2001 et 2015
Nicolas Berthet (Institut Pasteur), Andriniaina Andy Nkili Meyong (Centre International de Recherches Médicales de Francevile (CIRMF)), Emmanuel Nakouné Yandoko (Institut Pasteur de Bangui - RCA), Benjamin Selekon (Institut Pasteur de Bangui - RCA), Ingrid Labouba (Centre International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF)), Antoine Gessain (Institut Pasteur), Jean-Claude Manuguerra (Institut Pasteur)
Résumé
11 h 30
Construction d’un pipeline d’analyse métatranscriptomique dédié à l’exploration des insectes vecteurs en Afrique
Vanesa Boukouba (Université de Rouen), Nicolas Berthet (Institut Pasteur), Judicaël Obame - Nkoghe (Centre international de recherches médicales de Franceville (CIRMF) - GABON), Christophe Paupy (Institut de recherche et développement (IRD) - FRANCE), Eric Leroy (Institut de recherche et développement (IRD) - FRANCE), Catherine Dauga (Institut Pasteur - FRANCE)
Résumé
11 h 50
Plateforme de séquençage à haut débit en Afrique Centrale : une réalité au CIRMF - GABON
Ingrid Labouba (Centre International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF))
Résumé
12 h 10
Mot de clôture