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Les mélanges de lois sont des modèles bien adaptés pour la modélisation de phénomènes hétérogènes ou non stationnaires où plusieurs populations aux caractéristiques distinctes sont observées. Lorsqu'il est impossible de connaître directement de quelle population provient chaque observation, ce type de modèle permet d'avoir une méthode automatique de classification. Les mélanges de lois à 2 composantes sont particulièrement intéressants pour les débits de pointes et les volumes de crues de bassins versants du Nord-est dela péninsule Québec-Labrador. Eneffet, ces séries d'observations semble…

Grb2 est une protéine adaptatrice impliquée dans la voie de signalisation des tyrosines kinases, notamment celle du facteur de croissance épidermique (EGF), stimulant entre autres la prolifération de divers types cellulaires. Son domaine SH2 permet de lier les tyrosines phosphorylées du récepteur activé, alors que ses deux domaines SH3 peuvent lier des régions riches en prolines (PRD) de plusieurs protéines différentes, notamment SOS, une enzyme activant la voie Ras/MAPK. De plus, Grb2 est impliqué dans l’internalisation du récepteur de l’EGF (EGFR). Itch est une ligase de l’ubiquitine ave…

La dérégulation des protéines ribosomiques peut engendrer de graves maladies comme le cancer et la maladie d’Alzheimer. Une meilleure compréhension de leurs rôles pourrait ouvrir de nouvelles voies de thérapies afin de détecter, traiter ou prévenir ces maladies. Chez la levure Saccharomyces cerevisiae, la protéine ribosomique S18 est exprimée à partir de gènes dupliqués qui génèrent des protéines de séquences identiques (S18A et S18B). Nos résultats d’immunoprécipitations indiquent que S18 est associée à plusieurs petites ribonucléoprotéines nucléolaires (snoRNP). Cependant, S18A et…

La présence de la tordeuse des bourgeons de l’épinette, Choristoneura fumirefana, est l’un des plus grands problèmes de l’industrie forestière au Canada. Cet insecte qui fait des ravages sur des cycles d’environ 25-35 ans, affecte considérablement l’approvisionnement en matière ligneuse. Malgré les nombreuses recherches portant sur cet insecte, les connaissances sur l’augmentation, la progression et le déclin des épidémies demeurent encore au stade d’hypothèse. Durant une infestation, la qualité nutritionnelle des arbres varie, ce qui affecte directement la performance de l’i…

L’anémie est un problème de santé humaine très important qui affecte plus de 40% des enfants d’âge préscolaire dans de nombreux pays du tiers monde. Cette situation peut être causée par une consommation de végétaux pauvres en Fe. En effet, l’agriculture dans certains types de sols mène à la production de plantes carencées en Fe.Nous avons étudié la réponse des plantes à une carence en Fe en utilisant des cultures de cellules hétérotrophes de Solanum tuberosum. Le manque de Fe induit un ralentissement important de la croissance des cellules. Le suivi de la multiplication des cellul…

La biogenèse des ribosomes dans le nucléole est un processus complexe et finement régulé. Plus de 200 facteurs nucléolaires sont nécessaires pour générer les sous-unités 40S et 60S du ribosome. Nos travaux portent sur Dbp4, une ARN hélicase essentielle à la production d’ARNr 18S chez la levure Saccharomyces cerevisiae. Dbp4 est très conservée et l’on retrouve des orthologues chez tous les eucaryotes.Nous avons trouvé que Dbp4 participe à la maturation des pré-ARNr en formant un complexe avec les protéines Enp2 et Bfr2, dont les homologues chez l’humain sont respectivement NOL…

Selon les derniers modèles associés aux changementsclimatiques, l'augmentation des températures sera caractérisée par des fluctuationsimportantes de la température (i.e. pulses de température). La réponse desorganismes face un tel stress thermique est très peu connue et difficile àprédire en raison des effets directs et indirects (via le niveau trophiquesupérieur ou inférieur) de la température sur chaque niveau trophique. Dans cetteoptique, nous avons réalisé des expériences en chambre de croissance pendantlesquelles nous avons exposés un système …

La cellulose est le principal polymère de glucose trouvé chez les végétaux et constitue une alternative au maïs comme source de carbone pour l’industrie des biocarburants. La libération des sucres qu’elle contient se bute à la résistance de ce polymère à l’hydrolyse enzymatique, réduisant la compétitivité de cette source carbone. La biotraitement consolidé est une stratégie de réduction des coûts de conversion de la cellulose qui réunit les étapes de production de cellulases, d’hydrolyse de la cellulose et de fermentation. Une telle stratégie nécessite le concours de microorganismes pouvan…

La biogenèse des ribosomes est un processus biologique essentiel à la croissance des cellules et à leur prolifération. Les principales étapes de ce processus sont effectuées dans le nucléole. Afin de mieux comprendre les mécanismes qui régulent la biogenèse des ribosomes, nous utilisons la levure Saccharomyces cerevisiae comme modèle puisque c’est dans cet organisme que ce processus est le plus étudié.Nop6 est une protéine nucléolaire constituée d’un domaine de liaison à l’ARN (RRM) flanqué de deux motifs « coiled-coil » (CC). La présence des CC suggère que Nop6 pourrait inte…

La cryptosporidiose bovine, causée par le parasite Cryptosporidium parvum, entraîne de la diarrhée et de la déshydratation chez les veaux nouveau-nés du Québec. Un taux de mortalité jusqu'à 10% est associé à cette maladie lorsque combinée à d'autres infections. Nous avançons l'hypothèse qu'injecter un vaccin sous-unitaire multivalent anti-C. parvum à des vaches en fin de gestation entraînera la production d'anticorps dans le colostrum qui protègeront passivement les veaux. Nous avons identifié, grâce à des analyses bioinformatiques, la portion la plus immunogénique de chacune des six proté…

Notre laboratoire a récemment caractérisé une nouvelle interaction entre la ligase de l’ubiquitineItch et une petite protéine lysosomale encore mal connue LITAF. Cette interactionpeut s’établit grâce à deux motifs PPXY situé dans la portion N-terminale deLITAF, qui sont reconnus par les domaines WW de Itch. Fait remarquable, laprésence de LITAF dans les cellules en culture modifie la distributionintracellulaire de Itch, qui passe d’une association avec les compartimentsendosomaux à une localisation lysosomale. Ce déplacement est dépendant de l’associatio…

La bactérie Aeromonas salmonicida est un pathogène opportuniste des milieux aquatiques qui cause une maladie nommée furonculose chez les salmonidés. Le séquençage de la souche 01-B526 d'A. salmonicida par la technologie du pyroséquençage a permis de trouver la présence d'un prophage qui pourrait avoir une influence sur la virulence de la bactérie. Le prophage a une taille de 50 kb et certains de ses cadres ouverts de lecture (ORFs) coderaient pour de potentiels facteurs de virulence. L'analyse de certains ORFs du prophage et de ses sites d'insertions dans le chromosome a ét…

Un grand nombre d’études d'association pan-génomiques ont été réalisées en utilisant des variations en nombre de copies (CNV) rares. La capacité à détecter une association repose sur la précision de la détection des CNV ainsi que sur les filtres utilisés lors du contrôle de qualité. Différents critères, seuils ou définitions se traduiront par une liste finale de CNV très différente en raison d’un changement dans les taux de faux positifs et de faux négatifs. L’objectif de la présente étude est de comparer les CNV obtenus à partir de deux plateformes de génotypage et selon des critères de c…

Par sa définition sur plusieurs aspects dont la physiologie et la philosophie, l’animal est considéré comme une entité vivante différente de l’être humain.  De plus, à la lumière des informations disponibles dans la littérature, l’animal est aussi considéré différemment de l’être humain en fonction de son statut sociétal et en fonction de la vision de son utilité pour l’être humain.  De ce fait, les médecins vétérinaires conçoivent l’animal-patient de façon distincte selon l’évaluation de ce que représente ce dernier pour chacun dans leur vie professionnelle et de leur vie personnelle.  Ce…

La virulence d’Aeromonas salmonicida un pathogène de poisson, dépend entre autres du système de sécrétion de type trois (SSTT). Les gènes codant ce système sont presque tous situés sur une région du plasmide pAsa5. En condition de stress, ce plasmide peu se réarranger et perdre la région du SSTT. De plus, le génome d’A. salmonicida est riche en séquences d’insertion (IS), des éléments mobiles pouvant provoquer des réarrangements de l’ADN. Trois copies d’une séquence d’insertion, l’IS11, encadrent les régions qui sont éliminées lors du réarrangement de pAsa5. Nous avons caract…

La confusion est une source de biais important en épidémiologie. Le score de propension est une méthode populaire pour la contrôler dans les études prospectives et le score de stratification représente un score d’équilibrage est utilisé pour les études rétrospectives. Notre étude évalue l’efficacité du score d’équilibrage en génétique.Nous comparons 3 méthodes : la stratification du score (SS), l’appareillement  au score (AS) et l'ajustement  pour le score (CAS). Nous avons simulé des données génétiques avec 6 covariables déséquilibrées entre cas et témoins. Pour …

Le principe de FULCRUM établit qu'un signal stimulant sous de seuil (entrant dans un sens) qui est synchrone avec un signal de facilitation (entrant dans un sens différent) peut être augmenté (jusqu'à un niveau maximal de résonance) et ensuite diminué par l'énergie et le contenu de fréquence du signal de facilitation. En conséquence la sensation du signal stimulant change selon la force de signal de facilitation. Dans ce contexte, les transitions de sensibilité représentent le changement de l'activité sous de seuil à une activité stimulée dans des neurones multi sensorielles. Initia…

L’expression transitoire de gène (ETG) est un bioprocédé rapide et économique, massivement utilisé en recherche et développement pour la production de protéines d'intérêt. Elle consiste à véhiculer du matériel génétique jusqu’aux noyaux de cellules cultivées en bioréacteur afin de les amener à produire une protéine recombinante d’intérêt potentiel. L’un des types de vecteurs les plus utilisés est un auto-assemblage sous forme de nanoparticule entre un polymère cationique et l’ADN exogène. L’obstacle majeur à l’optimisation de ce procédé est que la majorité du matériel génétique ayant été i…

 La coccidiose  reste encore un problème  majeurs dans les élevages de poulets, car elle entraine des pertes économiques considérables dues en partie au taux de morbidité élevé dans les exploitations et aux faibles résultats zootechniques. Le contrôle des coccidioses chez le poulet est basé  sur des moyens prophylactiques, utilisant des produits actifs sur les coccidies et bien récemment la vaccination, mais cette dernière reste inefficace. Des stratégies alternatives ont été développées pour un contrôle efficace des coccidioses. C’est le cas de l’association d’un anticoccidien ionophore, …

Eurytemora affinis, un copépode calanoïde, est un complexe d’espèces. Deux de ces clades sont géographiquement séparés dans la zone de turbidité maximale (ZTM) de l’estuaire moyen du St-Laurent. Le clade Atlantique (A) domine les eaux douces (<0,5psu) et le clade Nord-Atlantique (NA) domine les eaux salée (0,5-20psu). La salinité apparait comme le facteur environnemental responsable de cette ségrégation. Seulement, le clade A tolère de fortes salinités (15psu) mais est exclusivement situé dans la zone oligohaline malgré les forts courants de marée. Le but de cette étude est de défin…

Dans cette présentation, il sera question de la formation catalytique de liaisons C-N, via la fonctionnalisation intramoléculaire de liaisons C-H à l'aide de nitrènes métalliques.  Il y a quelques années, nous avons développé les N-tosyloxycarbamates comme précurseurs de nitrènes dérivés des dimères de rhodium, lesquels conduisent à des réactions d'insertion dans des liaisons C-H de façon intra- et intermoléculaire avec de très bons rendements.  Bien que cette approche synthétique permette de sauver plusieurs étapes de transformation de groupements fonctionnels et qu'elle soit catal…

L’objectif du travail est de caractériser les polysaccharides issus des espèces commerciales Nannochloropsis oculata, Pavlova lutheri et Isochrysis galbana, lesquelles sont reconnues comme une source alimentaire importante en aquaculture. Leur pouvoir antimicrobien contre des souches de micro-organismes pathogènes en aquaculture a également été évalué.L’extraction des pâtes de microalgues est effectuée en deux étapes : une extraction avec le méthanol pour enlever les pigments et les lipides suivie d’une extraction avec l’eau et d’une lyophilisation. Les pourcent…

Les vaccins synthétiques sont de nos jours difficiles à synthétiser à grande échelle pour qu'ils soient disponibles à la majorité de la population. Lier des unités saccharidiques de manière efficace, économique et verte est tout un défi synthétique. Actuellement, la synthèse polysaccharidique est surtout orientée vers des étapes de protection/déprotection qui prennent du temps, qui ne sont pas économiques en ajoutant des atomes qui seront enlevés plus tard, en utilisant des composés toxiques (métaux lourds, solvants chlorés…). Dans le contexte du développement de médicaments, nous proposon…

La catalyse asymétrique utilisant des liquides ioniques (LI) catalytiques est un sujet grandissant dans la synthèse organique. Plusieurs exemples de réactions catalytiques induites par les LI sont facilement retrouvés dans la littérature. En effet, les cations catalytiques y sont massivement rapportés. Nous voulons rapporter ici un très rare exemple d'un anion catalytique qui engendre de la chiralité dans une réaction d'addition de Michael. De plus, nous voulons rapporter la possibilité de recycler le mélange réactionnel afin de le réutiliser afin de poursuivre les synthèses asymétriques s…

Les acides aminés quaternaires jouent un rôle clé en chimie médicinale puisqu'ils permettent de modifier les propriétés structurales d'un peptide en plus de les rendre plus résistants aux protéases. Plus spécifiquement, les cystéines quaternaires, telle que la (R)-a-méthylcystéine, présentent un intérêt particulier, car elles permettent de rigidifier la structure d'un peptide via des ponts disulfures. De plus, cette unité se retrouve dans plusieurs produits naturels présentant une puissante inhibition du VIH-1, dont la thiangazole, la cyclothiazomycin, la largazole, les hioamides, l…